利用可能なソフトウェア(一覧)
CPUノード群、GPUノード群およびアプリケーションサーバで利用可能なソフトウェアは以下の通りです。
コンパイラ・開発環境等
名称 | CPUノード群 | GPUノード群 | アプリケーションサーバ | 備考 |
GCCコンパイラ | ○ | ○ | ○ | |
Java処理系 | ○ | ○ | ○ | |
Python処理系 | ○ | ○ | ○ | |
インテルoneAPIベース & HPCツールキット (Fortran/C/C++, VTune Profiler, Advisor) |
○ | ○ | ○ | |
NVIDIA HPC SDK | ○ | ○ | ||
NVIDIA CUDA Toolkit | ○ | ○ |
科学技術計算・通信ライブラリ
名称 | CPUノード群 | GPUノード群 | アプリケーションサーバ | 備考 |
インテルMPIライブラリ (通信) |
○ | ○ | ○ | |
インテルoneMKL (数値計算) |
○ | ○ | ○ | |
インテルIPP (画像・信号処理,データ圧縮) |
○ | ○ | ○ | |
インテルoneDAL,oneDNN,oneCCL (ビッグデータ,機械学習) |
○ | ○ | ○ | |
NVIDIAライブラリ (cuBLAS,cuSPARSE,cuFFT,cuDNN,NCCL等) |
○ | ○ | ||
FFTW | ○ | ○ | ○ | |
HDF5 | ○ | ○ | ○ | |
NetCDF | ○ | ○ | ○ | |
MAGMA | ○ | ○ |
アプリケーションソフトウェア
名称 | CPUノード群 | GPUノード群 | アプリケーションサーバ | バージョン | 備考 |
Gaussian | ○ | ○ | ○ | 16.C.01 | GPU未対応 |
GaussView ※1 | ○ (app2) | 6.1.1 | 大学・研究機関 関係者のみ |
||
V-FaSTAR | ○ | ○ | 4.2.0 | 大学・研究機関 関係者のみ |
|
Mathematica | ○ | 14.2 | 北大関係者のみ | ||
MATLAB ※2 | ○ (app1) | R2024b | 北大関係者のみ | ||
COMSOL Multiphysics ※3 | ○ | 6.3 | 北大関係者のみ | ||
FieldView | ○ | 2023.1 | 大学・研究機関 関係者のみ |
||
Fidelity Pointwise | ○ | 2023.2 | 大学・研究機関 関係者のみ |
||
FastX | ○ | 4 |
※1 GaussViewではGMMXアドオンが利用可能です。
※2 MATLABでは下記のToolboxが利用可能です。
Control System Toolbox, Symbolic Math Toolbox, Image Processing Toolbox, Optimization Toolbox, Signal Processing Toolbox, Simulink, Simulink Control Design, Simulink Design Optimization, Curve Fitting Toolbox, Stateflow, Wavelet Toolbox, Communications Toolbox, DSP System Toolbox, Simulink Coder, MATLAB Coder, Statistics and Machine Learning Toolbox, Fixed-Point Designer
※3 COMSOL Multiphysicsでは下記のモジュール・ライブラリが利用可能です。
AC/DCモジュール、伝熱モジュール、構造力学モジュール、CAD Import モジュール、材料ライブラリ、RF モジュール、波動光学モジュール、CFD モジュール、音響モジュール、パイプ流れモジュール、化学反応工学モジュール、腐食解析モジュール、MEMSモジュール、半導体モジュール、複合材料モジュール、プラズマモジュール、LiveLink for MATLAB
フリーソフトウェア
名称 | CPUノード群 | GPUノード群 | アプリケーションサーバ | バージョン | 備考 | |
OpenFOAM | ○ | ○ | v2406 | |||
GAMESS | ○ | ○ | 2024R2 | |||
WRF | ○ | ○ | 4.6.1 | |||
PHASE | ○ | ○ | 2024.01 | |||
FrontFlow/red | ○ | ○ | 3.0.000 | |||
GROMACS | CPU版 | ○ | ○ | 2024.4 | ||
GPU版 | ○ | 2024.4 | ||||
LAMMPS | CPU版 | ○ | ○ | 29Aug2024 | ||
GPU版 | ○ | 29Aug2024 | ||||
NAMD | CPU版 | ○ | ○ | 3.0.1 | ||
GPU版 | ○ | 3.0.1 | ||||
MEEP | ○ | ○ | 1.29.0 | |||
Blast | ○ | ○ | 2.16.0 | |||
MyPresto | ○ | ○ | 1.1.103 | |||
Quantum ESPRESSO | CPU版 | ○ | ○ | 7.3.1, 7.4.1 | ||
GPU版 | ○ | 7.4.1 | ||||
VMD | ○ | ○ | 1.9.3 | |||
GrADS | ○ | ○ | 2.2.3 | |||
OpenMX | ○ | ○ | 3.9 | |||
Tensorflow | CPU版 | ○ | ○ | 2.17.1 | ||
GPU版 | ○ | 2.17.1 | ||||
PyTorch | CPU版 | ○ | ○ | 2.6.0 | ||
GPU版 | ○ | 2.6.0 | ||||
Keras | CPU版 | ○ | ○ | 3.9.0 | ||
GPU版 | ○ | 3.9.2 | ||||
Horovod | CPU版 | ○ | ○ | 0.28.1 | ||
GPU版 | ○ | 0.28.1 | ||||
Apache MXnet | CPU版 | ○ | ○ | 1.9.1 | ||
GPU版 | ○ | 1.9.1 |
※ フリーソフトウェアのインストールは済ませていますが、動作確認は可能な範囲内での実施となっております。
RIST (高度情報科学技術研究機構) 整備アプリケーション
各アプリケーションの詳細についてはこちらを参照してください。
名称 | CPUノード群 | GPUノード群 | アプリケーションサーバ | バージョン | 備考 |
ABINIT-MP | ○ | v1r22, v2r8 |
コンテナ環境
名称 | CPUノード群 | GPUノード群 | アプリケーションサーバ | 備考 |
Singularity Community Edition | ○ | ○ |